纳米技术与产业中日合作基地是2007年12月经科技部国际合作司批准设立的我国纳米技术与产业领域中的第一个国际科技合作基地。基地落户于纳米技术及应用国家工程研究中心，由中心统一进行管理并组织开展相关工作。
基地成立的宗旨是为中日双方科技人员与产业界搭建交流合作平台，促进两国纳米技术与产业的交流与合作，培养纳米技术与应用的创新人才，进一步加深两国人民之间的了解和感情。
基地的主要任务是推动纳米环境与能源技术、纳米仿生材料、纳米功能材料及国际纳米标准等诸多前沿技术尽快与国际接轨，积极参与国际合作；以纳米技术与产业为核心，以“强强合作”的交流方式, 培养纳米技术及产业的紧缺人才和领军人物；借鉴日本先进的学术思想和产学研机制，促进两国在纳米技术及应用领域的产学研合作。
“国际科技合作基地”的称号的取得不仅是科技部对中心在对外交流方面所做的工作的一种充分肯定，也是对中心未来的发展所寄予的一种厚望，更是在上海市纳米科技与产业发展促进中心不断推进纳米科技与产业发展进程中所奠定的基础之上取得的一种成绩。中心全体员工表示，一定以此为契机，抓住机遇，继续发挥自身的优势，不断扩大交流范围和交流层面，用更加突出的业绩回报上级领导对中心的信任和厚爱。
